小核酸生物信息科学家

职位介绍
岗位职责
1. 靶点筛选与序列设计：负责小核酸药物的靶点发现与序列设计，针对靶基因进行全转录组靶向区域分析、脱靶效应等预测与热力学稳定性评估。
2.生信流程开发：构建和优化小核酸药物专用的生物信息学分析 Pipeline，包含修饰位点设计、RNA 二级 / 三级结构预测、血清稳定性及靶向结合能力模拟。
3.前沿算法引入：跟踪并应用人工智能在 RNA 结构预测、序列活性预测及碱基修饰影响评估中的前沿算法，提升设计成功率。
4.脱靶预测与安全性评估，开发并维护脱靶预测分析流程：非靶基因同源性分析（NM/NR序列比对）种子区域（Seed region）匹配分析，saRNA-like、Zipper-like等非常规脱靶模式识别，整合公共脱靶数据库与内部实验数据，建立脱靶风险评估模型，为项目团队提供脱靶分析报告，优化PCC筛选
5. 专利挖掘与知识产权支持，针对特定靶点进行专利文献调研与分析，识别已有专利的保护范围与潜在冲突，挖掘可专利化的序列空间，协助设计具有自主知识产权的序列，参与撰写专利申请文件，提供生物信息学数据支持
6. 多组学数据分析与平台建设，建立并维护生信分析流程（RNA-seq、scRNA-seq、WES、ATAC-seq、ChIP-seq等），开发自动化分析管道（Docker、Snakemake、WDL等），提升分析效率，构建内部靶点-序列数据库，支撑研发决策
7. 跨部门协作，与药理团队协作：提供靶点表达数据、递送策略建议，与化学团队协作：反馈序列优化建议、修饰策略，与项目负责人协作：参与项目会议，汇报生信分析进展，与外部CRO协作：管理外包生信分析项目。
8. 前沿技术追踪，跟踪小核酸领域前沿技术动态（新靶点、新递送策略、新分析算法），探索AI/机器学习在序列设计、脱靶预测中的应用，定期进行技术分享，赋能团队。
9.参与靶点发现与验证工作，对候选靶点进行可成药性评估（组织特异性、表达水平、保守性、致病机制等），与药理团队协作，为靶点实验验证提供数据支持

任职要求
教育背景：生物信息学、计算生物学、RNA 生物学、系统生物学等相关专业，硕士以上学历。
计算环境：精通 Linux 环境，熟练掌握 Python、R 或 Shell 进行高效开发与数据分析，具备集群（SGE/Slurm/Kubernetes）部署与 Docker 容器化经验。
专业知识：精通 RNA 生物学，深刻理解 ASO/siRNA 的作用机制、化学修饰（如 2'-OMe, 2'-F, PS 骨架）对药效及特异性的影响。
工具能力：熟练掌握 RNA 专用分析工具（如 RNAfold/ViennaRNA、Bowtie2、Blast、Mfold、RNAcofold 等）。
经验要求
制药企业、CRO 或知名科研院所的小核酸（siRNA/ASO/mRNA）生物信息设计与分析经验。
具备独立开发过成熟的小核酸设计与脱靶预测 Pipeline 者优先。
能够同时优化小核酸修饰者优先。
有过其他 AI 项目经验（例如抗体生成 / 优化，小分子或肽类生成 / 优化）者优先。

其他信息

行业要求：全部行业