岗位描述
核心职责:
数据分析与解读:
独立处理单细胞及空间转录组数据,完成质控、比对、降维、聚类、差异表达、细胞互作、空间特征挖掘等分析。
熟悉空间转录组学工具(如Seurat、Scanpy、Giotto、SpaGCN、BayesSpace等),解析空间异质性、细胞邻域分析、基因表达空间模式等。
整合多组学数据(如单细胞+空间转录组+蛋白组)挖掘生物学意义。
流程开发与优化:
搭建标准化生信分析流程,开发自动化脚本(Python/R),提高分析效率与可重复性。
探索新算法/工具(如深度学习在空间数据中的应用),解决复杂生物学问题。
任职要求:
生物信息学、计算生物学、统计学或相关专业硕士及以上学历(优秀本科生可放宽)。
2年以上单细胞和空间转录组项目经验,熟悉常见数据格式(h5ad、loom、SpatialExperiment等)。
精通Python/R编程,熟练使用Linux/HPC环境及生信工具(如Cell Ranger、Space Ranger、STAR)。
熟悉基因组学数据库(如UCSC、GEO、SingleCellPortal)、通路分析工具(DAVID、GSEA)。
具备良好的英文文献阅读能力和团队协作精神。
优先条件:
有空间多组学或跨物种数据分析经验。
发表过单细胞/空间转录组相关论文(一作或核心贡献者)。
熟悉云计算(AWS/GCP)或容器技术(Docker/Singularity)。
Base地点:上海、深圳