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上海国资国企

数据库挖掘与蛋白评估

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岗位描述

岗位职责
1、协助利用PDB、UniProt等公共数据库,完成靶点蛋白结构检索、序列比对、同源建模及功能域注释等基础生信分析工作;
2、协助开展蛋白保守性分析、翻译后修饰位点预测等系统性生物信息学分析,为药物虚拟筛选提供结构生物学支撑;
3、参与基于GROMACS软件的蛋白-配体复合物分子动力学模拟全流程,协助完成体系搭建、能量优化、平衡模拟及生产模拟等工作;
4、协助运用MM/PBSA、FEP等方法完成结合自由能计算,分析关键氨基酸残基的结合贡献与作用机制;
5、学习并熟练掌握公司自研光谱计算与反演平台,协助完成蛋白、配体拉曼、红外等理论振动光谱计算与结果分析;
6、协助关联分析MD模拟轨迹与光谱反演数据,验证仿真结果的实验可观测性,形成闭环分析逻辑;
7、配合AI算法团队,将分子模拟与光谱数据整理转化为模型特征向量,支撑药物活性预测模型训练工作;
8、协助撰写标准化技术报告,梳理模拟数据、光谱拟合结果与分析结论。

任职要求
1、硕士及以上学历,计算生物学、生物物理、物理化学、药物化学等相关专业应届毕业生;
2、熟悉PDB、UniProt数据库使用方法,了解PDB文件结构、序列检索与蛋白功能注释流程;
3、掌握GROMACS分子动力学模拟基础流程,了解体系溶解、离子添加、参数生成、静电处理等常用操作,有相关课题、毕设实操经验优先;
4、熟练使用Python/Shell脚本进行数据处理,熟悉Linux系统及集群作业提交、管理基本操作;
5、具备扎实的量子化学、光谱学基础,理解简正模式、偶极矩变化等核心概念,具备较强的工具学习与原理钻研能力;
6、对AI制药、干湿结合、模拟-实验闭环研发模式有清晰认知与浓厚兴趣;
7、具备良好的英文文献阅读能力,能够复现顶刊基础模拟与光谱分析流程,逻辑清晰、善于总结沉淀。

生物医药方向的申请准备

先核对岗位要求与自己的经历,再准备档案、投递和面试。

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