岗位描述
岗位职责
前沿技术研究:聚焦多肽/环肽计算生物学与生成式 AI 交叉领域,开展创新研究,重点攻关基于扩散模型、流匹配模型、蛋白质语言模型等 AI 技术的环肽设计与优化方法。
算法工程化与平台搭建:与部门计算、AI、药物化学及湿实验团队协同,将前沿设计算法工程化,搭建高稳定、高效率、可扩展的环肽计算发现平台;应用统计学、机器学习等方法,开发溶解度、膜渗透性等成药性预测算法模块,实现“序列生成—性质评估—迭代优化”一站式计算能力。
项目设计与交付:深度参与环肽药物发现项目,协同或独立完成靶点表位筛选、环肽分子设计与筛选,生成高质量候选分子,完成亲和力、成药性等多维度计算评估与序列改进,输出可实验验证的设计方案(包括序列、结构、修饰位点及合成建议等)。
数据驱动算法迭代:基于湿实验验证数据,构建“计算设计—实验验证—模型迭代”数据闭环,持续优化生成模型与设计流程。
跨团队协作与需求支持:与湿实验、药物化学等团队紧密协作,支持实验方案设计与结果解读;完成团队交办的其他与多肽/环肽设计、改造及计算平台相关的任务。
任职要求
计算生物学、生物信息学、计算化学、系统生物学等相关专业博士学历;或具备突出相关项目经验的硕士。拥有生成式 AI、深度学习、多肽/环肽药物发现等产学研经验者优先。
精通 Python 编程,熟练使用 PyTorch/TensorFlow 等深度学习框架;掌握统计建模、机器学习、深度学习方法,具备蛋白质/环肽语言模型微调经验;具备良好的工程化习惯,熟悉 Linux、Git、Docker 等工具者优先。
有多肽/环肽从头设计(de novo design)实际项目经验者优先;有扩散模型、流匹配、自回归生成等技术在环肽设计算法开发中的应用经验者优先。
具备 Rosetta、分子动力学(MD)模拟经验者优先,包括环肽结构建模、构象采样、结合模式预测、稳定性/亲和力评估等。
具备优秀英文文献读写能力,能快速追踪、复现与提炼领域顶会/顶刊进展;具备严谨科学思维,有相关领域高水平学术成果、专利或开源项目者优先。
良好的团队协作与跨部门沟通能力,学习能力强,能快速将前沿算法落地到实际药物研发流程;对 AI 驱动药物发现具有强烈兴趣。
加分项
有多肽/环肽结构特征、非天然氨基酸、环化修饰及构效关系研究经验;
有湿实验协作或 AI+湿实验闭环项目经验;
有药物研发项目交付经验或候选分子推进经验;
在相关领域顶会/顶刊发表论文,或拥有专利、高质量开源项目。