岗位描述
1.多肽药物设计与优化: 主导多肽、环肽、口服肽及穿膜肽项目的计算设计工作。利用构象分析、分子动力学模拟、自由能微扰(FEP)等方法,优化多肽的亲和力、选择性、稳定性及膜通透性。
2.口服肽与穿膜机制研究: 开发或应用计算模型(如构象 ensembles 分析、极性表面积计算、膜渗透性预测模型)来指导口服肽、穿膜肽的化学修饰和骨架改造。
3.环化策略开发: 探索新型环化链接方式(如头到尾、侧链到侧链、二硫键mimetics)的计算模拟方法,评估环化对多肽构象刚性和活性的影响。
4.AI辅助设计协作: 与AI算法工程师紧密配合,为AI模型的训练提供领域知识指导(如特征工程、正负样本定义、物理合理性约束);对AI生成的多肽序列进行基于物理模型的虚拟筛选和验证(分子对接、动力学评估),形成“AI生成 + 物理过滤”的闭环工作流。
5.跨学科协作: 与结构生物学团队紧密合作,解析靶点-多肽复合物结构;与实验化学家沟通,确保计算设计的合成可行性和可优化性。
6.技术平台建设: 参与搭建针对多肽特性的计算平台,包括非标准氨基酸力场参数化、多肽专属打分函数开发等。
任职要求:
1.教育背景: 计算化学、物理化学、药物化学、生物物理学等相关专业博士学历。
2.精通分子动力学模拟软件(如Amber, GROMACS, Desmond)及分析技术(MM-PBSA/GBSA,元动力学)。
3.熟悉多肽结构预测工具(如PEP-FOLD, Rosetta FlexPepDock)及构象采样方法。
4.对多肽的物理化学性质(LogP, LogD, 溶解性, 渗透性)有深刻理解。
5.熟悉机器学习/AI在药物发现中的基本应用,能够理解和解释AI模型的输出(如注意力权重、潜在空间表示),并能将其转化为化学假设;具备基本的Python数据处理能力(如使用Pandas处理训练数据)。
6.加分项: 有口服肽、环肽或穿膜肽实际项目经验;有与AI工程师协作完成项目的经历;熟悉Linux环境及脚本编写。
.个人素质: 具备出色的解决问题的能力,能够在跨功能团队中有效沟通,对新型治疗模式(如多肽、RNA)有强烈的好奇心,愿意成为“物理模型”与“AI模型”之间的桥梁。